تضم كلية بغداد للعلوم الطبية (كلية بغداد للصيدلة سابقا) في هيكليتها الحالية قسم الصيدلة و قسم التمريض, تأسست الكلية في بغداد عام 2000 من قبل نقابة صيادلة العراق والتي كانت تضم في أول تأسيسها قسم واحد فقط وهو قسم الصيدلة تهدف الكلية الى إعداد صيادلة تتوفر فيهم الكفاءة العلمية والفنية للقيام بالخدمات الصيدلانية والتحاليل الكيمياوية في العراق. حيث صدرت موافقة وزارة التعليم العالي والبحث العلمي على إنشاء الكلية بتاريخ 14\9\2000 بموجب إحكام المادة (38) من قانون الجامعات والكليات الأهلية رقم  13 لسنة 1996 والمعدل بالقانون رقم (57) لسنة2002  وتم استحداث فروع القسم منذ بداية التأسيس وهي كالأتي:

فرع الصيدلانيات و فرع الكيمياء الصيدلانية والعقاقير و فرع العلاجات والصيدلة السريرية

كانت الكلية تشغل مبنى مؤقتا ملحقا بدار التمريض بمنطقة باب المعظم قرب كلية الطب – جامعة بغداد ، وقد تخرجت الدفعة الأولى بدرجة بكالوريوس علوم صيدلة في العام 2005 , في العام 2006 تم تحول الكلية لموقعها الحالي وهي بناية وزارة الأوقاف/ سابقا. استحصلت الكلية بتاريخ 10\10\2018 على موافقة معالي الوزير المحترم لأستحداث قسم  للدراسة الصباحية – التمريض في الكلية في الكلية في محافظة بغداد للعام الدراسي 2018-2019  وحسب كتاب الوزارة المرقم ت ه/أق/ 17719 وبتاريخ  15\10\2018 سعيا منها للمساهمة في إعداد كوادر تمريضية قادرة على المساعدة الطبية في المؤسسات الطبية وضمن اطر عالمية من المعرفة والأداء لخدمة المجتمع وتتحمل المسؤولية لرعاية المرضى والمحتاجين لخدمة صحة المجتمع. وبذلك تحول الاسم الرسمي للكلية إلى كلية بغداد للعلوم الطبية وتسعى كلية بغداد للعلوم الطبية في خطة مستقبلية لفتح تخصصات أخرى في المجال الطبي كاستحداث قسم الطب البشري والدراسات العليا في الكلية.

اعتمدت الكلية من بداية تأسيسها المناهج المقررة والمفردات والموضوعات الدراسية التي تعتمدها الجامعات الرسمية وتخضع الشهادات والدرجات العلمية التي تمنحها الكلية لقواعد تقييم الشهادات والدرجات العلمية المعتمدة في وزارة التعليم العالي والبحث العلمي كما تخضع نشاطات الكلية لمراقبة وزارة التعليم العالي والبحث العلمي من خلال محاضر اجتماعات مجلس الكلية والتقارير السنوية التي تعنى بوضعها الدراسي والمالي.

تضم الكلية احدث المختبرات العلمية التي يلجأ اليها الباحثون وطلبة الدراسات العليا من مختلف الكليات الاخرى وكذلك تضم الكلية مكتبة فيها احدث الكتب العلمية ووحدة للانترنيت والرياضة وغيرها.

و لأجل الارتقاء بواقع التعليم ولراحة طلبتنا الأعزاء ونتيجة للتوسع في مقاعد القبول وفتح قسم التمريض…. لذا بدأ العمل ببناء موقع الكلية الجديد والمتكون من ستة طوابق حيث تحتوي هذه البناية على قاعات واسعة ومختبرات حديثة وستجهز بأحدث الأجهزة المختبرية إضافة إلى سرداب ليكون كراج للسيارات وبأحدث التصاميم الهندسية ونادي كبير لراحة الطلبة ومكتبة مجهزة بأحدث الكتب العلمية والذي أوشك العمل فيها على الانتهاء مقبل العام القادم.